Desarrollar marcadores de microsatélites para la especie alpaca (Lama pacos), con el fin de obtener información sobre características genotípicas cualitativas y cuantitativas de interés productivo y de otra índole
Crear una biblioteca genómica para alpaca; Identificar el o los tipos de microsatélites presentes en el genoma de alpaca y seleccionar clones de esta genoteca que presenten las senales mas fuertes por hibridización tipo Southern.; Secuenciar los clones positivios para definir con precisión la estructura genética de los microsatelites aislados y para dilucidar las regiones adyacentes a ellos.; Disenar partidores de PCR que sean capaces de amplificar regiones del genoma que contengan a los microsatélites y determinar aquellos que den la mayor información en base al nivel del polimorfismo detectado.; Describir la variabilidad genética para una población de 30 a 50 alpacas.6. Describir la variabilidad genética (status subespecífico, pureza genética e historia evolutiv de poblaciones cautivas y silvestres de CSA, incluyendo estudios de famili7 Comenzar el desarrollo de un mapa de ligamiento de la especie alpaca, para lo cual de deben definir las relaciones entre la información genotípica obtenida y el fenotipo de los animales muestreados.8. Capacitar personal y establecer un laboratorio de referencia para análisis genético de CSA en Chil;
Se desarrollaron marcadores de microsatélites para la especie alpaca. Se identifico una cantidad cercana a 70 marcadores de microsatélites, de los cuales aprox. 40 fueron seleccionados por ser altamente informativos, no sólo en alpacas sino también en las otras tres especies de CSA. Algunos de los marcadores de microsatélites desarrollados han sido incluso seleccionados por el Centro de Genotipificación de Alpacas y Llamas (ARI) en U.S.A. para realizar la filiación de sus animales. Se desarrollaron y optimizaron con éxito los protocolos tendientes a la obtención de una Biblioteca Genómica de DNA de alpaca. Este punto fue crucial para la posterior selección de microsatélites obtenidos en este proyecto. El laboratorio de biotecnología de La Platina adquirió las capacidades y experiencias para constituirse en un centro de referencia para identificación genética animal. Se han diseñado partidores de PCR que han permitido definir las relaciones de similitud genética entre las especies de camélidos sudamericanos. Para este mismo propósito se optimizo el uso de otras técnicas moleculares (RAPD y AFLP) y se inicio el desarrollo de marcadores especie-específicas (SCAR).