Generar un mapa de distribución de las variantes genéticas de M bovis prevalentes en el país, apoyado en una red interdisciplinaria que garantice la representatividad del patógeno en cada región geográfica.
Disenar una estrategia de aislamiento de cepas con trazabilidad registrada para garantizar la debida representación de cepas por región. Identificar los focos de alta y baja prevalencia de tuberculosis bovina, focos con persistencia y brotes de la enfermedad para recolección de cepas representativas de cada grupo. Corroborar la identidad de las cepas recolectadas mediante PCR tiempo real (BoviMan) específico para M bovis. Registrar el perfil genético de las cepas de M bovis utilizando como marcador genético el polimorfismo del locus DR obtenido por de análisis de espoligotipos. Generar una base de datos de los perfiles genéticos de M bovis para el posterior análisis de distribución de clusters. Elaboración de un mapa geográfico que localice los grupos o clusters de cepas según su localización geográfica y antecedentes epidemiológicos. Análisis epidemiológico del mapa de distribución genética de M bovis con el fin de extraer conclusiones respecto a rutas de diseminación del patógeno, factores de riesgo y definir el origen endógeno o exógeno de brotes o persistencia del patógeno en una localida; Transferir la tecnología de genotipificación a los Laboratorios autorizados para el diagnóstico de bTB (Laboratorios SAG) con el objeto de sustentar actualizado el mapade distribución del patógeno. El logro de este objetivo permitirá contar además con un mayor número de laboratorios y con ello, alcanzar el análisis de un mayor número decepas genotipificadas.
Resultados esperados al finalizar el Proyecto 1. Obtención de un protocolo de obtención de cepas para mantener actualizado el mapa de distribución geográfica y asi poder registrar la evolución del patógeno en el país. 2. Disponer de un mapa de distribución geográfica con los puntos localizados de focos de alta y baja prevalencia de tuberculosis bovina, focos con persistencia y brotes de la enfermedad para recolección de cepas representativas de cada grupo. 3. Contar con el registro de los perfiles genéticos de al menos 1400 cepas de distintas regiones del país, provenientes de rebaños infectados y animales domésticos y silvestres de los cuales se obtengan cepas de M bovis. 4. Generar una base de datos de los perfiles genéticos de M. bovis y relacionarlos con la base de datos internacional (www.mbovis.org) para el estudio evolutivo del patógeno y su relación con los países con los cuales Chile comercializa 5. Disponer de un registro de las condiciones epidemiológicas asociadas a la distribución de M bovis con el objeto de controlar factores de riesgo que contribuyen a la diseminación del patógeno. 6. Este proyecto fortalecerá el programa de erradicación de bTB, culminando con Laboratorios autorizados, capacitados e implementados con la tecnología genética de punta para la genotipificación de M bovis y diagnóstico molecular basado en la técnica de PCR tiempo real oficial.